أولاً، على الرغم من أن كلا النوعين من أجهزة تنقية المياه يمكنهما تنقية شوائب المياه، إلا أن مبادئ التنقية الخاصة بهما ليست واحدة. تم تجهيز جهاز تنقية المياه بالتناضح العكسي RO بغشاء التناضح العكسي RO بالداخل. تحت تأثير الضغط، يمكن أن يمر الماء عبر غشاء RO، بينما يتم حظر الشوائب مثل الأملاح غير العضوية وأيونات المعادن الثقيلة والبكتيريا والفيروسات بواسطة غشاء التناضح العكسي.

تقوم أجهزة تنقية المياه بالترشيح الفائق بتنقية مصدر المياه من خلال غشاء الترشيح الفائق الداخلي الخاص بها. تحت ضغط فرق الضغط، يمكن لمصدر المياه المرور عبر هذه الطبقة من الغشاء وتصفية الشوائب.

لدى نوعي أجهزة تنقية المياه، اللذين يستخدمان طرق تنقية مختلفة، اختلافات معينة في دقة التنقية وفقًا لمبادئهما. يحتوي جهاز تنقية المياه بالتناضح العكسي RO على غشاء RO بالداخل، ومسام هذا الغشاء صغيرة مثل مستوى النانومتر. حتى الفيروسات والبكتيريا الصغيرة أكبر بآلاف المرات من مسام غشاء RO. ولذلك، فإن الماء الذي يمر عبر غشاء RO يحتوي بشكل أساسي على الماء فقط ولا يحتوي على أي عناصر أخرى، ويمكن شرب الماء المفلتر مباشرة أو غليه.

يحتوي جهاز تنقية المياه بالترشيح الفائق على غشاء ترشيح فائق بالداخل، ونطاق دقة حجم المسام لغشاء الترشيح هذا هو 0.01~0.001μm، وهو أمر أكبر بدرجة واحدة من جهاز تنقية المياه بالتناضح العكسي RO. وفي الوقت نفسه، لا يسمح غشاء الترشيح الفائق بمرور الماء فحسب، بل يسمح أيضًا بمرور بعض المواد الجزيئية الصغيرة ذات الأحجام الأصغر، مثل بعض العناصر المعدنية.